手术是用于肿瘤分期和减积。分期是确定癌症在体内扩散的程度。减积是尽可能除掉越多的肿瘤。这种手术通常是切除输卵管和卵巢（称为输卵管卵巢切除术），子宫（子宫切除术），移除网膜（卵巢切除术），淋巴结活组织检查以及与瘤疾有关的任何其他器官。为了达致“最佳减积”，至少不应留下大于1厘米的单个瘤。为了获得“最佳减瘤”，患者本身可能需要在手术前进行几轮化学疗法（新辅助化疗）。

任何患者的身体健康若足以让他忍受化疗的，通常会从中受益匪浅。最初诊断时，通常的一线方法是给予双铂核药物和紫杉烷类药物的组合。在卵巢癌中可以考虑替代组合或单一药剂化疗方案。

基质和生殖细胞卵巢肿瘤通常用化疗药物的组合治疗。对于这方面肿瘤的研究较少，因为它们比上皮肿瘤更易于治愈且更不常见。

靶向治疗靶向癌症的特定基因，蛋白质或有助于癌症生长和存活的细胞组织环境。这种类型的治疗可阻止癌细胞的生长和扩散，同时限制对健康细胞的损害。为了找到最有效的治疗方案，我们的肿瘤科医生可能会进行检测以鉴定肿瘤中的基因，蛋白质和其他因素。

一般上，约20％的高级别肿瘤在乳腺癌易感基因（BRCA）中具有突变。即使仅在肿瘤而非血液中发现乳腺癌易感基因突变，也可能会提高聚腺苷二磷酸核糖聚合酶（PARP）抑制剂的有效性。较不常见的卵巢癌，诸如低级别浆液性癌，子宫内膜样腺癌和透明细胞癌，可能会在苏氨酸蛋白激酶（BRAF），PIK3CA((一种蛋白激酶的编码基因))和磷酸酯酶与张力蛋白同源物（Phosphatase and tensin homolog，PTEN）之类的基因中表达突变。

1）聚腺苷二磷酸核糖聚合酶（PARP）抑制剂会阻断涉及修复受损DNA的酶，从而导致细胞死亡并减慢或阻止肿瘤的生长。乳腺癌易感基因通常参与DNA修复，这些基因中的突变会干扰该途径的功能。聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂使原本具有乳腺癌易感基因突变的细胞难以生长和分裂。

2）抗血管内皮生长因子单克隆抗体可有效地阻止称为血管内皮生长因子（VEGF）的蛋白质的作用，并阻止新血管的形成。因为肿瘤需要由血管递送的营养物质来生长和传播，所以抗血管生成疗法的目标是“饿死”肿瘤。

激素疗法诸如选择性雌激素受体调节剂（SERM）药物和芳香酶抑制剂等更常用于治疗恶性间质肿瘤，例如复发性颗粒细胞瘤。

免疫疗法是妇科恶性肿瘤的新兴领域，包括卵巢癌。免疫疗法是一种使用患者的免疫系统对抗癌症的疗法。目前，免疫疗法获准用于微卫星不稳定性（MSI） - 阳性卵巢癌。